Frische Muscheln wäscht man zunächst unter fließend kaltem Wasser ab.
Eventuell noch anhaftende Kleinkrebse, die Seepocken, lassen sich gut mit der Wurzelbürste oder dem Messer abkratzen. Hängen zwischen den Schalen noch Byssusfäden, die sogenannten „Bärte“ der Muscheln, zieht man sie heraus. Geöffnete Muscheln müssen nur dann aussortiert werden, wenn sie ihre Schalen nach dem Klopftest (etwa mit einem Teelöffel) nicht schließen. Sollen die Muscheln im rohen Zustand geöffnet werden, fährt man dazu mit einem kleinen stabilen Messer – am besten einem speziellen Austernmesser – zwischen die Schalen und führt es an der Innenseite entlang, bis sich die obere Schale lösen lässt.